日本投降时的一个重要问题是盟军对日本占领的性质问题。战胜国对现任政府乃至天皇是应该保留还是应该废弃?是应该由美国的军政官员直接对日本行使县至县、省至省的行政管辖权吗?盟军在占领意大利和德国时采取的方式是在当地建立盟军临时政府(A. M. G),并将它作为战斗部队不可分割的一部分,而地方事务的行政管理权则掌握在盟军行政官员的手中。那么,在日本投降后,太平洋区域盟军临时政府的负责人希望在日本也采取同样的占领模式。日本方面不知道自己还能保留多少行政方面的职权。波茨坦公告上只是说∶“盟国必须对日本领土上部分地区进行有效占领,以此来确保盟军基本战略目标的实现,并彻底清除日本国内残余的煽动日本民众发动世界战争的黑暗势力。”