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作者:Anonymous 在 罕见奇谈 发贴, 来自 http://www.hjclub.org
中科院27岁女博导:是现实 不是神话消息源::中国科学院遗传与发育生物学研究所
【八阕】 http://www.popyard.org
【八阕】王秀杰女, 博士, 1977年出生。研究员, 博士生导师。 【八阕:PopYard.Org】
http://www.genetics.ac.cn/Research/sysjs/wangxiujie.htm
1998年获南开大学生物学学士学位, 2000年获香港科技大学生物化学硕士学位, 2004年获洛克菲勒大学(The Rockefeller University) 生物信息学博士学位, 同年在洛克菲勒大学从事博士后研究。2004年度入选中国科学院“百人计划”。
王秀杰博士领导的创新研究组的主要研究方向是生物信息学。我们将发挥计算机在处理大规模生物学数据上的优势, 运用现代生物信息学技术, 对公共数据库中的生物数据, 尤其是与基因组相关的数据进行分析和数据挖掘, 以从宏观上阐释生命调控的规律。
近期的主要研究内容包括:
1. 真核生物中microRNA调控机理的研究, microRNA 及其所调节的mRNA 的预测。
MicroRNAs 是真核生物自身编码的一类长度为20- 25 nt的具有重要调节功能的小分子RNA。已知的microRNA 的主要生物学功能是通过序列互补性与它们的靶mRNA 相结合, 从而调节靶mRNA的表达水平。尽管近几年在microRNA的发现和功能研究上有了较大进展, 但我们对microRNA自身的转录调节机制仍知之甚少。我们拟发展新的算法来寻找microRNA前体中与转录相关的特征序列, 并以此作为依据来优化microRNA及其靶mRNA的预测方法。
2. Alternative splicing 和alternative polyadenylation 机制的研究。
选择性拼接(alternative splicing) 和选择性多聚腺苷酸化(alternative polyadenylation)是两种常见的真核生物前体mRNA (pre-mRNA)转录后加工的方法,其结果是从一个前体mRNA (pre-mRNA) 上产生出不同的mRNA。Alternative splicing 和alternative polyadenylation 有可能是决定生物体种间差异的重要原因。我们希望能根据已知的alternative splicing 和alternative polyadenylation 的数据,寻找出决定alternative splicing 和alternative polyadenylation的因素,并以此来预测新的alternative splicing 和alternative polyadenylation 的位点。同时我们也将设计生物学实验对部分预测结果进行证明。
3. Intron/Exon boundary 的确定和水稻基因组的重新分析。
目前广泛使用的基因预测方法在确定外显子和内含子的边际上(Intron/Exon boundary) 还远远不够精确。我们将采用生物信息学和实验生物学相结合的方法, 对部分水稻基因的Intron/Exon boundary进行测量,并以此为基础优化现有的基因预测方法,以提高对Intron/Exon boundary 预测的准确性。
我们将与国内外的生物学家紧密合作,通过生物学实验来验证和优化我们的预测方法。
欢迎有志于生物信息学和植物分子生物学的学生报考本实验室研究生。
Key Publications:
1. Wang XJ, Reyes JL, Chua NH and Gaasterland T (2004). Prediction and identification of Arabidopsis thaliana
microRNA genes and their mRNA targets. Genome Biology 5:R65. (此杂志尚未被SCI收录)
2. Hoth S, Ikeda Y, Morganteb M, Wang X, Zuo J, Hanafey MK, Gaasterland T, Tingey SV and Chua NH (2003).
Monitoring genome-wide changes in gene expression in response to endogenous cytokinin reveals targets in
Arabidopsis thaliana. FEBS Lett. 554, 373-380.
3. Wang X, Ching YP, Lam WH, Qi Z, Zhang M and Wang JH (2000). Identification of a common protein association
region in the neuronal Cdk5 activator. J. Biol Chem. 275, 31763-31769. (请注意发表的年份,属于硕士阶段的工作)
呵呵,怎么看,都好像是个毕业困难户,怎么就......
中国真是个善于创造奇迹般的丑闻的沃土。
作者:Anonymous 在 罕见奇谈 发贴, 来自 http://www.hjclub.org |
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